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自动化医学成像框架彻底改变了血吸虫病诊断

2023-08-09 12:53:07    出处:互联网


(资料图)

导读 血吸虫病是一种寄生虫病,影响着全世界数百万人,造成了重大的公共卫生和经济负担,特别是在贫困地区。为了对抗这种疾病并实现世界卫生组织...

血吸虫病是一种寄生虫病,影响着全世界数百万人,造成了重大的公共卫生和经济负担,特别是在贫困地区。为了对抗这种疾病并实现世界卫生组织 (WHO) 的控制和消除目标,准确且易于使用的诊断工具至关重要。目前,显微镜检查是诊断血吸虫病的标准,但它耗时、依赖操作人员,并且需要专业知识,这对于资源有限的地区来说具有挑战性。

为了应对这些挑战,研究人员开发了 Schistscope,这是一种配备自动对焦和自动载玻片扫描系统的创新光学工具。该设备可捕获尿液样本的显微镜图像,从而能够有效检测埃及血吸虫卵(泌尿生殖道血吸虫病的常见原因)。在《医学影像杂志》上发表的一项研究中,研究人员旨在创建一个强大的数据集,并使用深度学习开发一个两阶段诊断框架,以在现场环境中准确识别和计数埃及沙门氏菌 (SH) 卵。

首先,研究人员创建了一个 SH 数据集,其中包含在尼日利亚中部农村地区收集并使用 Schistscope 设备捕获的 12,051 个尿液样本图像。他们手动对图像进行注释,对鸡蛋进行标记,并将其与晶体、玻璃碎片、气泡和纤维等可能妨碍准确诊断的人工制品区分开来。

所提出的两阶段诊断框架由 DeepLabv3 和 MobilenetV3 主干深度卷积神经网络组成,并使用 SH 数据集上的迁移学习进行训练。在第一阶段,该框架执行语义分割以识别捕获图像中的候选 SH 蛋。第二阶段通过拟合重叠椭圆来细化分割,有效分离聚类鸡蛋的边界,从而获得更准确的鸡蛋计数。

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